La crypte du XIe siècle ou église basse, par son antériorité, par sa forme et la puissance de sa masse, sert en quelque sorte de racines à la cathédrale gothique.
Elle est le seul témoin qui demeure de l’édifice construit par Fulbert. D'une dimension exceptionnelle, elle comprenait deux galeries de 78 mètres de long réunies par un déambulatoire demi-circulaire qui ouvrait sur trois chapelles rayonnantes. L’église haute a disparu dans le grand incendie de 1194.
En 1864, l’une des chapelles rayonnantes de cette crypte fut dédiée à Fulbert.
Pour commémorer le neuvième centenaire de la mort de celui-ci, les ateliers Lorin, sur des cartons de Gabriel Loire, dotèrent cette chapelle de deux vitraux. Ils montrent le grand évêque dans l’exercice des deux activités les plus marquantes de son épiscopat chartrain.
